• #79 The Wizard of Fz

  • Sep 15 2024
  • Length: 3 hrs and 18 mins
  • Podcast

  • Summary

  • Broadの齋藤諒さん再登場。真核生物ゲノムにコードされたFanzorがRNAで標的をプログラム可能なエンドヌクレアーゼであることを示した論文、競合、ジョブハント、来年1月から理研で主宰予定のラボ運営方針について伺いました (8/31収録) Show Notes (番組HP): 齋藤さん過去回 1 2齋藤ラボ理研ECLページでの紹介齋藤ラボ公募ページ(研究員・特別研究員)齋藤ラボ公募ページ(パートタイマー・アルバイト)理研 和光キャンパス 開拓研究本部トークしたイベント濡木先生西増先生井上梓先生古館昌平さんの回 1 2 論文パート Fanzor論文最近のCell論文Feng ZhangラボCas9ゲノム編集論文Cas9ゲノム編集@ヒト細胞 1 2Cas12Cas13Cas9祖先トランスポゾン論文Eugene KooninOMEGA論文CASTホーミングについての齋藤さん前報平野清一さんのIsrB構造論文ゲノム編集で病気も治るようになってきたトマトでGABAを増やす魚で白身を増やすJennifer Doudna達のFz論文IS (Insertion Sequence):転移に最低限必要な酵素のみを内部にコードするトランスポゾンの一種。それぞれ番号がついていて、転移機構も色々。IS200/IS605IS6072013年のFanzor命名論文AlphaFoldOmar Abudayyeh(おまー)Jonathan Gootenberg(ぐーばー)合同ラボBioRxivのプレプリントHERMESSamuel SternbergのHERMESイジりScience Advances論文TnpBのペーパーVirginijus SiksnysKavli賞SoumyaHan毛みたいなほわっとしたカビATCCツボカビSpizellomyces punctatus濡木先生とSiksnysのTnpBの構造論文 1 2末端配列とガイドRNA(ωRNA)配列の関係:これのcSpuのめっちゃ綺麗な末端配列:これのaツボカビにも一応エレクトロポレーションはあるPAM(Protospacer Adjacent Motif):CRISPR-Casシステムにおいて、Cas9などのエフェクターがDNA切断を行う際に、標的配列の隣に必要とするモチーフ。SpCas9では3’側にNGG。TAM(Target-Adjacent Motif):OMEGAシステムには“Protospacer”という概念が存在しないため、このように呼ぶ。TAM、トランスポゾン、ガイドとなっている:これのaPeel-and-paste:これのbSam SternbergのSelfish Spreadの論文(機構はFig. 5g)転写因子(TnpB様の転写抑制因子)の論文OMEGAのペーパーが出た時のNews and ViewsRobert DesimoneRSIの成果報告会で受賞したのが公表されたページCSHLのCRISPR MeetingHanのTnpBのペーパーCRISPR nuclease-protease加藤一希先生Jonathan StreckerとEsraのCRISPR associated endopeptidase論文StreckerのCAST論文Peiyu XuGuilhem FaureCOVID-19で一緒に働いたJulia Joungの転写因子アトラスMax WilkinsonのR2論文R2レトロトランスポゾンのレビューR2を使った挿入ツール 1 2David LiuDavid LiuのtwinPEOmar + Goober のPASTEPASTEを基盤技術にしたTome Bioscienceの最近の動向Jonathan WeissmanCas活性のパラメータについての仕事の一例登さんDeliveryの話、例えばコレ昔のラボメンはK99取ってたマイキーのPEG10 ジョブハントパート 小関先生医科研のUTOPIA早稲田にいた時の自分の指導教官UTOPIAについて一応調べた(100日でワクチン開発でした。。。 by齋藤) 東大の真下先生Cas3の論文五神真先生大阪大学の蛋白質研究所定量研と卓越研究員制度今年は加藤セチプログラムのみMax君は本当にすごいRockefellerインタビュー6人中2人がうちのラボKalliHelen Hay WhitneyHanna GrayAviv RegevXiaowei ZhuangAdam CohenマイキーのラボMax Wilkinsonの出身ラボKalliの出身ラボ 独立後の計画 Joshua WeinsteinDNA MicroscopyPatrick HsuBridge RNA宮脇さんが有識者の回有識者会議科研費倍増への運動後藤由希子先生Kendallスイスで会ったギタリストの友達本田圭佑HFSPミーティング長田重一先生アポトーシスの写真二階堂先生 ありがとうございました、引き続きよろしくお願いいたします!(by齋藤)加藤英明先生 ありがとうございました、引き続きよろしくお願いいたします!(by齋藤)奥山先生 ありがとうございました、引き続きよろしくお願いいたします!(by齋藤)Susan GasserPatrick Matthiasアセチル化やってた論文吉田稔先生古細菌テーマ@HFSP二段階になったHFSPフェローシップ申請(このReview Procedureタブを参照。Letters of IntentとFull Proposals)Yi Zhang小嶋さん寺坂さん松田真弥さん松本さん古館さんのNature論文長井淳さん 飲みましょう!!!(by齋藤)齋藤さんMITのアドレス Editorial Notes: 夢をみることができなければ、未来を変えることはできません。— 華麗なる一族(TBSテレビ, ...
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